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Browsing by Author "Fernández Izquierdo, Pablo"

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  • Contraste entre un modelo matemático y el proceso de biorreducción de Cr(VI) por consorcios de bacterias aisladas de agua residual del Rio Pasto

    Institución: Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca

    Revista: NOVA

    Autores: Pinta Melo, Jhonatan; Guerrero Ceballos, Deisy Lorena; Cerón Gómez, Miller Orlando; Fernández Izquierdo, Pablo; Ibarguen Mondragón, Eduardo; Burbano Rosero, Edith Mariela

    Fecha de publicación en la Revista: 2023-05-01

    Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-04-30

    Introducción. El metabolismo versátil de los microorganismos permite la biodegradación de una amplia variedad de contaminantes, sin embargo, la creciente ampliación de la industria supera su capacidad de procesamiento de poluentes. El cromo hexavalente Cr(VI) debido a su alta toxicidad es uno de los metales pesados de mayor difusión y preocupación a nivel global. Existen numerosas investigaciones enfocadas en proponer tratamientos para depurar los diferentes ecosistemas afectados con este metal; no obstante, el conocimiento sobre diversos microorganismos de una misma fuente que podrían ayudar a solucionar esta problemática se ve restringido. Objetivo. Evaluar la eficiencia en la reducción de Cr(VI) de consorcios bacterianos (B. thuringiensis, B. amyloliquefaciens y Paenibacillus sp.) en un tratamiento tipo Batch, utilizando como sustrato agua residual municipal del Río Pasto. Metodología. Se formuló un modelo matemático que predijo de manera confiable el comportamiento de los consorcios, con relación a su crecimiento y el porcentaje de reducción, los resultados de las simulaciones fueron comparados con datos experimentales para seleccionar el consorcio con mejores resultados de reducción de Cr(VI). Posteriormente, se determinó su eficiencia en la reducción de Cr(VI), usando como sustrato agua residual del rio sin esterilizar. Resultados. Los análisis estadísticos resaltaron la ausencia de diferencias estadísticamente significativas en los porcentajes de reducción entre los consorcios. No obstante, con el cultivo seleccionado se presentó un porcentaje de reducción de 91% en 156 horas. Conclusión. Los resultados encontrados en esta investigación son promisorios para su aplicación en el mejoramiento de las prácticas de tratamiento para la biorremediación de Cr(VI).
  • CYP1A1, TNFα Genes and environmental factors associated with gastric cancer in patients from Pasto-Colombia

    Institución: Universidad Colegio Mayor de Cundinamarca

    Revista: REVISTA NOVA

    Autores: Paz, Cesar Orlando; Mena Huertas, Jaqueline; Fernández Izquierdo, Pablo; Burbano-Rosero, Edith Mariela; Pazos, Alvaro

    Fecha de publicación en la Revista: 2024-11-15

    Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-11-20

    Introduction. In Pasto, Nariño, Colombian, the gastric cancer (GC) incidence is one of the highest in the world. It is known that in the GC the CYP1A1 and TNFα human susceptibility to cancer genes are involved along to environmental factors to pathogenesis GC. Although the relationship among environmental factors and human genetic predisposition to gastric cancer is still unknown. Aim. To evaluate the environmental factors and GC human genetic predisposition (CYP1A1 and TNFα genes) association in patients with GC diagnose in Pasto. Methods. This is a cross-sectional, descriptive and observational study that included 10 gastric cancers positive and surviving cases. We studied the genetic predisposition to gastric by the  CYP1A1 and TNFα genetic biomarkers. The genetic variability was determined by SNPs and RFLP in silico by gene sequences bioinformatic analysis. The environmental and familiar factors were analyzed through surveys. Results. In all our cases (n=10) we found gene risk alleles in high frequency (TNFα 40%, CYP1A1 50%). We observed that the 60% of GC genetic susceptibility were significate associated to age (p<0.05). While the environmental, genetics and familiar did not showed associated to CYP1A1 and TNFα prevalence. An association of smoking with a low genetic variability of the TNFα risk gene was found. Conclusion: The high-risk gene frequencies CYP1A1 and TNFα suggest the presence of gastric cancer human susceptibility in GC diagnosed patients. In the cases observed, the human susceptibility to GC is associated to advanced age and smoking.
  • Genes CYP1A1, FNTα Y factores ambientales asociados a cáncer gástrico en pacientes de Pasto-Colombia

    Institución: Universidad Nacional Abierta y a Distancia

    Revista: NOVA

    Autores: Paz, Cesar Orlando; Mena Huertas, Jaqueline; Fernández Izquierdo, Pablo; Burbano-Rosero, Edith Mariela; Pazos, Alvaro

    Fecha de publicación en la Revista: 2024-11-15

    Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-11-20

    Introducción: En Pasto-Nariño, Colombia, la incidencia de cáncer gástrico (CG) es una de las más altas del mundo. En la patogénesis del CG están implicados tanto los genes CYP1A1 y FNTα, como los factores ambientales. La relación entre factores ambientales y la predisposición genética humana a CG, aún se desconoce. Objetivo: Evaluar la asociación entre factores ambientales y la predisposición genética humana a CG (Genes CYP1A1, FNTα) en pacientes con diagnóstico de CG en la ciudad de Pasto. Metodología:Estudio transversal, descriptivo y observacional que incluyó 10 casos sobrevivientes y diagnosticados de CG. Se evaluaron dos biomarcadores de predisposición genética CYP1A1 y FNTα. Las secuencias de genes fueron usadas para determinar la variabilidad genética mediante SNPs y RFLPs in silico. Los factores ambientales y familiares se evaluaron a partir de encuestas. Resultados: Altas frecuencias de los alelos de riesgo de los genes (FNTα=40%, CYP1A1=50%) fueron observadas en todos los casos. Se encontró que 60% de los casos con susceptibilidad genética a CG se asociaron significativamente con la edad (p<0.05), mientras que los factores ambientales y genéticos-familiares evaluados no se asocian con la prevalencia de CYP1A1 y FNTα. Se encontró asociación del hábito tabáquico con una baja variabilidad del gen de riesgo FNTα. Conclusión: Las altas frecuencias de los alelos de riesgo de CYP1A1 y FNTα sugieren la presencia de susceptibilidad humana a CG en los pacientes con diagnóstico de la enfermedad.  En los casos observados, la susceptibilidad humana a CG se asocia con la edad avanzada y el hábito tabáquico.
  • Aislamiento y caracterización de bacterias productoras de polihidroxialcanoato a partir de muestras de agua de mar (Tumaco)

    Institución: Pontificia Universidad Javeriana

    Revista: Universitas Scientiarum

    Autores: Fernández Izquierdo, Pablo; Villota-Calvachi, Guido Ernesto; Otero-Ramírez, Iván; Hidalgo-Bonilla, Sandra Patricia; Quiroz Cabrera, Maira Alejandra; Gomez Arrieta, Jenny Dimelza; Burbano Rosero, Edith Mariela

    Fecha de publicación en la Revista: 2023-06-23

    Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2025-03-28

    Introducción. Los polihidroxialcanoatos (PHA) son una familia de poliésteres que comprenden más de 100 tipos de homopolímeros y heteropolímeros que pueden ser producidos por microorganismos a partir de fuentes de carbono renovables, lo que los convierte en materiales sustitutos de los plásticos, sostenibles y respetuosos con el medio ambiente. Actualmente, la producción de biopolímeros no es competitiva en términos de costos yrendimiento en comparación con los polímeros sintéticos; sin embargo, la producción por diferentes cepas bacterianas puede proporcionar viabilidad económica y ecológica si se realizan inversiones en esta área, ya que hay evidencia de que el bioplástico acumula genes de resistencia a antibióticos (ARG) y genes de resistencia a metales (MRG) en sedimentos marinos. Objetivo. El objetivo de este trabajo fue aislar y caracterizar molecular y bioquímicamente bacterias productoras de PHA presentes en muestras de agua obtenidas de cinco sitios (estaciones de servicio) en las regiones costeras de la Isla de Tumaco, Nariño-Colombia, y determinar la susceptibilidad antimicrobiana de las muestras obtenidas, ya que su papelbiológico va más allá de su función de almacenamiento porque su presencia en el citoplasma mejora la resistencia al estrés de los microorganismos. Materiales y métodos. Se aislaron colonias bacterianas a partir de muestras de agua. Se utilizó un método de tinción de colonias viables utilizando Rojo Nilo para seleccionar bacterias productoras de PHA. Las colonias aisladas se caracterizaron mediante métodos bioquímicos, microbiológicos y moleculares,y se sometieron a pruebas de susceptibilidad antimicrobiana y fermentación. El extracto crudo se analizó mediante técnicas de GC-MS/MS. Resultados. Más de treinta y ocho cepas fueron identificadas como posibles aislados positivos para PHA siguiendo el enfoque de selección previamente expuesto, pero solo un aislado resultó viable para la producción de PHA (T2-25A). Todas las muestras aisladas fueron resistentes a metronidazol, ampicilina,trimetoprima sulfametoxazol, cefalotina, ceftriaxona y cefazolina, y el 27.3 % fueron resistentes a novobiocina. Conclusiones. Se obtuvo una cepa con potencial para la producción de PHA. No obstante, esta información complementará estudios futuros sobre las condicionesnecesarias para producir PHA. Adicionalmente, los datos sobre resistencia a los antibióticos llamaron nuestra atención, especialmente debido al origen de las aguas donde obtuvimos los aislados.
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