En la edad moderna, el Gobernador era un oficial real que se encargaba de la administración de los territorios a nivel provincial, al igual que el virrey era la representación del rey en el territorio indiano. En cada provincia el gobernador representaba la máxima autoridad judicial y política. Asimismo, con frecuencia eran capitanes generales, estando así investidos también de la suprema autoridad militar, por lo tanto, se les puede considerar líderes multifacéticos. La existencia de esta figura política se debe a la implantación de un sistema de gobernadores en Las Indias por parte de la corona.  Pedro Fernández de Busto viajó hacia Las Indias en 1553 con su familia, entre ellos, García de Busto, su hermano, quien venía a asumir el cargo de Gobernador de Popayán, sin embargo, la embarcación en que se transportaban se incendió, Pedro sobrevivió al incidente por lo que la Audiencia Santa Fe confió provisionalmente la gobernación de Popayán.