El objetivo de la presente investigación fue determinar la respuesta de un inoculante con base en cepas de Bradyrhizobium japonicum a la adición de alginato, en presencia de los fungicidas Carbendazim® y Fludioxonil®, peletizados en semillas de soya. El experimento consistió de ocho tratamientos completamente al azar, con un arreglo factorial 3x2, con tres repeticiones por triplicado. La estimación de sobrevivencia bacteriana, como variable de respuesta, fue realizada en tres tiempos de secado: 0, 24 y 48 horas. Los datos fueron expresados como [Log10 UFC/mL]. Los resultados mostraron que los dos fungicidas reducen significativamente (p<0.05) la viabilidad de B . japonicum . El fungicida Fludioxonil® presentó mayor efecto inhibitorio que Carbendazim®, con más del 25% de reducción, a las 48 horas . Además, se demostró que el alginato promueve la adherencia sobre las semillas de soya y la protección de las bacterias, disminuyendo la acción inhibitoria (p<0.05), después de las 24 horas. Estos resultados sugieren que la aplicación de polímeros en inoculantes bacterianos representa una alternativa promisoria, para disminuir los efectos nocivos de fungicidas, sobre su viabilidad celular.