Introducción: El Cryptosporidium spp. (C. spp.) es uno de los principales agentes causales de diarrea en niños. En Colombia, hay pocos estudios de prevalencia en niños sanos. Objetivo: Determinar la prevalencia de C. spp. mediante ELISA en niños de Cali, Colombia. Materiales y métodos: Estudio descriptivo observacional de corte transversal en 107 niños sanos < 10 años, de la Comuna 18 de Cali, Colombia, quienes consultaron al Programa de Crecimiento y Desarrollo del Centro de Salud Lourdes. El análisis estadísticoincluyó medidas de tendencia central, de dispersión y pruebas de asociación. Se incluyeron datos como edad, género, signos y síntomas, peso (P) y talla (T), ycondiciones ambientales. Según las tablas de la NCHS fueron clasificados según grado de desnutrición (DNT). La identificación del C. spp., se realizó en materia fecalmediante la técnica de ELISA. Resultados: Fueron analizados 100 niños, 66% estrato 1, con edad = 4 años ± 2 meses, 50 niños, 30% en hacinamiento, 95% con agua potable, 85% con disposición de excretas, 52% con animales intradomiciliares, y 63% asisten a guardería o colegio. Ninguno de los niños C. spp. positivos, presentósíntomas. Tuvieron P = 16±6 kg y T = 97±18 cm, 40% con algún tipo de DNT. La prevalencia fue del 4% (IC 95% 0,1-7,89) sin diferencias significativas (p>0.05). Conclusiones: La prevalencia para C. spp. fue del 4% sin posibles asociaciones demográficas, ambientales oclínicas.