El  articulo  propone  que,  en  el  actual  proceso  de profundización del Sistema Nacional de Innovación en Chile, es necesario construir y potenciar Sistemas Regionales  de  Innovación como  estrategia  para incorporar los procesos de localización de la innovación, de manera tal que sea posible articular las prioridades nacionales (clusterización selectiva) con los procesos emergentes de innovación territorial  potenciados desde el nivel sub-nacional (regiones). En este contexto, se propone un modelo de gestión regional de la innovación y se examina la propuesta metodológica de Inteligencia Competitiva Regional, en sus dimensiones de análisis regional de las capacidades y potencial de Ciencia Tecnología e Innovación. Se propone una  estrategia, un conjunto articulado de técnicas e indicadores relativos a Capital Humano Avanzado, generación de redes tecno-económicas y tecno-científicas, indicadores de focos de CTI, de  prioridades de inversión pública y de la dinámica económica sectorial/regional. Estos indicadores, son construidos con el horizonte de iniciar procesos de modelación y simulación de Sistemas Regionales de Innovación en  procesos de prospectiva tecnológica