Las bacterias epifíticas de macroalgas marinas sintetizan enzimas de interés industrial y biotecnológico. En este estudio, se obtuvieron dos fragmentos de DNA candidatos para enzimas degradadoras de lípidos del total de DNA de bacterias epifíticas asociadas a Ulva lactuca. En primer lugar, se evaluó un método para el aislamiento del DNA bacteriano total de la superficie del talo de U. lactuca. Posteriormente, se diseñaron conjuntos de primers y se usaron directamente para amplificación por PCR. Los productos PCR resultantes se analizaron por secuenciación y se utilizaron para expresión y evaluación funcional con el sistema Escherichia coli pBAD-TOPO. Se obtuvo DNA bacterial total de alto peso molecular y buena calidad, que sirvió como plantilla para identificar un fragmento correspondiente a una Acetil-CoA C-Acetiltransferasa (o Tiolasa) y un fragmento candidato para una “verdadera” lipasa versátil. El fragmento de gen de la posible “verdadera” lipasa se expresó heterólogamente en Escherichia coli y se obtuvo prueba de actividad hidrolítica en medios de Tributirina, Tween-20 y aceite de oliva. De este estudio resultó nuevo conocimiento sobre bacterias epifíticas asociadas a U. lactuca como posibles nuevas fuentes de enzimas, tales como tiolasas y“verdaderas” lipasas. Sin embargo, se requieren estudios en el futuro que describan las características y aplicaciones importantes de estas enzimas candidatas.