Browsing by Author "Rojas, Salvador"
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- Caracterización Morfológica y Agronómica de la Colección Nacional de Germoplasma de Jatropha curcas L.
Institución: Universidad de los Llanos
Revista: Orinoquia
Autores: Guerrero Pinilla, Jorge A.; Campuzano, Luis F.; Rojas, Salvador; Pachon-García, Jorge
Fecha de publicación en la Revista: 2011-09-15
Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-04-30
Titulo en ingles: Morphological and Agronomic Characterisation of the Jatropha curcas L. Colombian Germplasm collection.RESUMEN: Con el objetivo de estimar la diversidad genética de la colección colombiana de germoplasma de Jatropha curcas L., con un total de 246 accesiones colectadas en estado silvestre en distintas regiones del país, se llevó a cabo una caracterización morfológica y agronómica mediante la medición de 27 características genéticas de tipo cualitativo y cuantitativo. El estudio se basó en métodos de estadística multivariada para hallar la variabilidad genética entre las accesiones. Las distancias obtenidas en el dendograma posibilitaron formar 18 grupos al estimar el coeficiente de disimilaridad DICE entre los caracteres asociados a componentes de producción, características agronómicas y descriptores de interés específico, asociados a 10 componentes principales que logran explicar el 78,25 % de la variación. La caracterización morfológica permitió determinar la variabilidad genética dentro de las accesiones en especial los descriptores de disposición de arquitectura de planta, porte de las plantas, longitud de la parte de la rama no lignificada y color del látex. La importancia del estudio radica en el manejo y uso de estas accesiones en programas de mejoramiento genético tradicional o asistido por marcadores moleculares conforme al aprovechamiento de la especie en la agroindustria con fines energéticos en la producción de agrocombustibles. Palabras clave: Descriptores, Variabilidad Genética, Jatropha curcas L., Agrocombustibles.ABSTRACT: In order to determine the genetic diversity of the colombian germplasm collection of Jatropha curcas L., established with a total of 246 wild accessions collected in different regions of the country, it was carried out a morphological and agronomical characterization using 27 genetic traits either qualitative or quantitative type. The study was based on multivariable statistics statistical to determine the genetic variability among accessions. The distances in the dendrogram made possible to stablish 18 groups based on the DICE dissimilarity coefficient between the characters associated with yield components, agronomic characteristics, and specific descriptors of interest related to 10 principal components obtained from 20 quantitative evaluated descriptors. Morphological characterization allowed us to determine the presence of genetic variability within accessions especially descriptors available to plant architecture, plant size, length of the not lignified branch, latex color and this study of the Jatropha germplasm collection allows the handling and use of accessions in traditional plant and molecular markers assisted programs according to the use of the species for energy purposes in the production of agrofuels.Key words: Descriptors, Genetic Variability, Jatropha curcas L., Agrofuels. - Desenvolvimento e mapeamento de microssatélites gênicos (EST-SSRs) de camu-camu (Myrciaria dubia [H.B.K.] McVaugh)
Institución: Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria
Revista: Ciencia y Tecnología Agropecuaria
Autores: Rojas, Salvador; Rodrigues, Doriani; Lima, Marcicleide; Astolfi Fhilo, Spartaco
Fecha de publicación en la Revista: 2008-07-06
Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-09-23
Descrevemos o desenvolvimento marcadores de nucleotídeos repetidos em tandem de seqüências expressas (EST-SSRs) o microssatélites gênicos de camu-camu, a qual é uma pequena fruta nativa da Amazônia que cotem o mais alto conteúdo de vitamina C natural de qualquer fruteira conhecida no mundo. Dois mil seqüências da biblioteca de ESTs de camu-camu foram analisadas e 219 EST-SSRs para o desenvolvimento de marcadores moleculares foram identificadas e analisadas. Dos 219 EST-SSRs 74,2% foram perfeitos simples e 22,7% perfeitos interrompidos. Os EST-SSRs foram 13% trinucleotídeos e 87% dinucleotídeos; os dinucleotídeos mais freqüentes foram GA, CT, AG e TC motivos comuns em outras dicotiledôneas. Os marcadores obtidos foram usados para identificar seu poder de amplificação para detectar polimorfismos e testar a transferibilidade com quatro espécies da família Mirtaceae; além disso, foram comparados com seqüências de proteínas de outras espécies depositadas nas bases de dados do National Center for Biotechnology Information NCBI. Dos EST-SSRs, 20,8% tiveram boas características para o desenho de “primers”, deste grupo 15 “primers” foram sintetizados, oito apresentaram polimorfismo para o camu-camu detectando em 139 acessos de camu-camu entre 7 e 21 alelos/loci, alem disso, seis de estes EST-SSRs amplificaram em quatro espécies mirtáceas. As seqüências dos oito EST-SSRs tiveram alguma relação com proteínas conhecidas, cinco apresentaram valores entre <1E-51 e <1E-109. Esta metodologia de obtenção de EST-SSRs de camu-camu a partir de informações de bases de dados públicas ou bibliotecas disponíveis, pode ser aplicada a baixo custo em outras espécies para estudos de diversidade, transferibilidade e nos estudos de similaridade com proteínas conhecidas. - Diversidade genética em acessos do banco de germoplasma de camu-camu (Myrciaria dúbia [H.B.K.] McVaugh) do INPA usando marcadores microssatélites (EST-SSR).
Institución: Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria
Revista: Ciencia y Tecnología Agropecuaria
Autores: Rojas, Salvador; Clement , Yuyama; Nagao, Eduardo Ossamu
Fecha de publicación en la Revista: 2010-12-29
Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-09-23
O conhecimento da diversidade genética das espécies amazônicas é de grande importância para a domesticação e melhoramento das culturas. Uma das grandes dificuldades em espécies não domesticadas como o camu-camu é a falta de informação sobre a sua variabilidade genética. Devido ao potencial econômico do camu-camu por sua alta produção de vitamina C, foi realizado o presente trabalho, o qual tem como objetivo estimar a variabilidade genética de 139 acessos de camu-camu oriundos de 17 populações de diferentes rios da Amazônia brasileira, conservados no banco de germoplasma (BAG) de camu-camu do Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia INPA na cidade de Manaus, utilizando marcadores EST-SSR. Oito loci de EST-SSR detectaram um total de 102 alelos com uma média de 12,87 alelos por loco. Os resultados mostram altos níveis de diversidade para todos os locicom uma média de heterozigosidade esperada (He) de 0,797 e heterozigosidade total (Ht) de 0,502. As populações apresentaram altos valores de endogamia, o que sugere déficit de heterozigotos como observado pelos baixos valores de Heterozigosidade observada (H0), provavelmente devido ao isolamento das populações e as distâncias entre elas, o que limita o fluxo gênico favorecendo a endogamia. O valor de diferenciação genética (FST) foi alto 0,21 indicando uma alta variabilidade entre as populações. As medidas baseadas nas freqüências alélicas, amostraram uma maior variabilidade dentro das populações (80,3%) que entre as populações (19,7%). Através das distâncias genéticas entre as populações foi encontrada uma grande variação entre os acessos provenientes de populações de Rondônia (Jarú) e os provenientes de Amazonas (Pirarucu e Tarumã) e Roraima (Urubu). No ordenamento pelo método UPGMA, observou-se a formação de dois grupos principais e cinco sub-grupos os quais estão relacionados geograficamente. Os resultados revelaram a utilidade dos marcadores EST-SSR nos estudos de diversidade genética entre acessos do camu-camu. Estes resultados serão úteis no planejamento de novas coletas e conservação do BAG, no analise de variabilidade de populações, assim como no direcionamento de cruzamentos através da escolha de genótipos geneticamente divergentes, o que contribuirá às atividades de melhoramento de camu-camu nos paises amazônicos. - Parcela permanente de monitoreo de bosque de galería, en Puerto Gaitán, Meta
Institución: Corporación Colombiana de Investigación Agropecuaria
Revista: Ciencia y Tecnología Agropecuaria
Autores: Gutiérrez, Albert; García, Fernando; Rojas, Salvador; Castro, Francisco
Fecha de publicación en la Revista: 2015-12-30
Fecha de cosecha en Ciencia Nacional: 2024-09-23
En 2010, Corpoica inició, en la altillanura disectada, la instalación y estudio de la estructura y composición florística de una parcela permanente de una hectárea localizada en la unidad bioclimática tropical denominada bosque de galería; ubicada en el municipio de Puerto Gaitán, Meta. La parcela, se trazó y demarcó; luego, se identificaron y censaron todos los individuos con DAP mayor de diez centímetros. De acuerdo con la composición florística, se encontraron 519 individuos pertenecientes a 72 especies, 56 géneros y 36 familias de plantas leñosas. Las familias con mayor riqueza de especies fueron Burseraceae (5), Euphorbiaceae (5) y Clusiaceae (5). Los usos principales de las 72 especies fueron: 32 maderables, 18 alimentación de fauna, 10 protectores de microcuencas, 5 leña, 3 frutales, 1 tinte y 1 ornamental. La mayor altura registrada para la parcela fue de 21 metros reportados por individuos de las especies chaparro de agua (Panopsis rubescens) y merecurillo blanco (Licania kunthiana). Las especies tuno (Miconia sp.) y quincedias (Tapirira guianensis) fueron las dos de las especies con mayor índice de valor de importancia (IVI) 29,5 % y 23,8 %, respectivamente. Se observó en los análisis de estructura vertical y horizontal que, el estrato medio (Em) presentó una cobertura del 46,9 %, que corresponde a un área basal de (6,87 m2), el estrato superior (Es) 45,7 % (6,69 m2) y el estrato inferior (Ei) 7,41 % (1,09 m2). Los resultados sugieren que estas áreas son diversas tanto en la estructura como en la composición florística y esta diversidad está siendo afectada por la perturbación antrópica ya que hay presencia de claros por efecto de la tala selectiva.