En 1819 se proclamó la República de la Gran Colombia. Simón Bolívar fue el primer presidente y Francisco de Paula Santander su vicepresidente. El inicio de la República tuvo varios problemas de orden social, económico y político por resolver, los cuales no fueron impedimento para el desarrollo del conocimiento científico en el país. El objetivo de este artículo es analizar los hechos científicos que sucedieron entre 1820 y 1880, desde el concepto de Transculturación Científica. El artículo está dividido en tres apartados donde se abordan, cronológicamente, los avances de las disciplinas relacionadas con la historia natural. Se pudo concluir que en este periodo el desarrollo del conocimiento científico dejó grandes resultados y las bases para los futuros científicos nacionales.