Se registró la diversidad de herpetofauna (anfibios y reptiles) en 36 sistemas agroforestales concacao (SAF-Cacao) y 4 fragmentos de bosque (FB) en Waslala, Nicaragua. Se muestreo laherpetofauna en parcelas de 1000 m2 distribuidas en dos rangos altitudinales, durante dos épocasdel año (invierno y verano) y en turnos (diurnos y nocturnos). Se registraron variables ambientalesy estructurales de todos los hábitats evaluados. Se aplicó un análisis de conglomerados usando 30variables cuantitativas, seguido de un análisis de componentes principales para identificar lasvariables responsables de la agrupación; y finalmente, se aplicó un ANOVA para determinar lasignificancia estadística entre las variables. Los tipos de hábitat formados fueron: cacao simple (CS),cacao multiestrato (CM), cacao denso (CD) y FB. Se registraron 453 individuos pertenecientes a 12familias, 20 géneros y 31 especies. El 61% de esa población fueron reptiles y el restante 39% fueronanfibios. La población de anfibios se distribuyó en el siguiente orden dentro de los tipos de hábitat:35% en CD, 34% en CM, 18% en FB y 13% en CS. La población de reptiles ocurrió en el siguienteorden: 42% en CM, 30% en CD, 16% en CS y 12% en FB. La riqueza, abundancia e índices dediversidad fueron similares entre los hábitat evaluados. La ocurrencia de accidentes ofídicos dentrode los SAF-Cacao y FB fue baja. Los SAF-Cacao de Waslala son buenos sitios para albergar laherpetofauna local. Se recomienda capacitar a los productores sobre el rol de la herpetofauna comocontroladores biológicos e indicadores de calidad ambiental, educar a la población sobre lasmedidas de prevención de accidentes ofídicos y reducir la aplicación de agroquímicos en los usosdel suelo colindantes a los SAF-Cacao y FB que puedan potencialmente afectar la diversidad deherpetofauna local.