La Universidad de Pamplona fue fundada por el presbítero Dr. Rafael Faría Bermúdez el 23 de noviembre de 1960. Las tecnologías en Servicio Social y Secretariado Comercial Bilingüe, son los programas con los que inicia su oferta académica. Después de una década como fundación universitaria privada, cambia su razón jurídica a universidad pública del orden departamental, a través del Decreto No. 0553 del 5 de agosto de 1970. Queda facultada por el Ministerio de Educación Nacional (MEN) para otorgar títulos universitarios a través del Decreto No. 1550 del 13 de agosto de 1971. Durante las dos décadas posteriores, la Universidad de Pamplona se posiciona en Colombia, al reconocer el desempeño de sus egresados de los programas de educación. A finales de la década de los noventa hasta inicios del siglo XXI, la universidad le apuesta a su crecimiento académico y aumento de la cobertura para los jóvenes de la región. Para este fin, crea distintos programas y facultades con los cuales amplía la oferta más allá de los programas de educación, consolidándose como la mejor universidad de la región. Actualmente, la Universidad de Pamplona en un constante compromiso con la cultura de la mejora permanente, es reconocida públicamente con la Acreditación Institucional de Alta Calidad por el MEN a través de la Resolución No. 0018143 del 27 de septiembre de 2021.