El presente trabajo de investigación tiene como objetivo conocer los cambios en el nivel de actividad física durante la transición en la etapa escolar que va de 6º de Educación Primaria a 1º de Educación Secundaria. Se ha realizado un estudio longitudinal descriptivo utilizando un cuestionario como instrumento de recogida de datos. La muestra total estaba formada por 542 alumnos, 50.2% eran chicos y 49.8% chicas con edades comprendidas entre 11-13 años, que fueron entrevistados en dos ocasiones: durante el sexto curso de educación primaria y posteriormente en primero de educación secundaria. Se utilizó el cuestionario de actividad física para niños Physical Activity Questionnaire for Children (PAQ-C), validado y traducido al castellano por Martínez-Gómez, et al. (2009). Los chicos son más activos que las chicas en ambas etapas, produciéndose un mayor aumento del número de chicas inactivas durante la transición de la Educación Primara a la Educación Secundaria.